Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms