Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC10P48553 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms