Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNT3P45378 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNNT3P45378 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms