Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSOP43234 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSOP43234 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSOP43234 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSOP43234 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSOP43234 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSOP43234 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSOP43234 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSOP43234 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSOP43234 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSOP43234 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSOP43234 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSOP43234 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSOP43234 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSOP43234 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSOP43234 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSOP43234 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTSOP43234 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTSOP43234 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTSOP43234 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTSOP43234 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSOP43234 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSOP43234 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSOP43234 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSOP43234 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSOP43234 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSOP43234 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSOP43234 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSOP43234 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSOP43234 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSOP43234 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSOP43234 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSOP43234 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSOP43234 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSOP43234 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSOP43234 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSOP43234 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSOP43234 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSOP43234 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSOP43234 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSOP43234 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSOP43234 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSOP43234 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSOP43234 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSOP43234 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSOP43234 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSOP43234 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSOP43234 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSOP43234 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSOP43234 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSOP43234 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSOP43234 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSOP43234 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSOP43234 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSOP43234 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSOP43234 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSOP43234 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSOP43234 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSOP43234 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSOP43234 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSOP43234 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSOP43234 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSOP43234 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSOP43234 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSOP43234 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSOP43234 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSOP43234 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSOP43234 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSOP43234 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSOP43234 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSOP43234 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSOP43234 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSOP43234 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSOP43234 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSOP43234 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSOP43234 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSOP43234 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSOP43234 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSOP43234 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSOP43234 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSOP43234 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSOP43234 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSOP43234 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSOP43234 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSOP43234 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSOP43234 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTSOP43234 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSOP43234 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSOP43234 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSOP43234 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSOP43234 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSOP43234 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSOP43234 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSOP43234 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSOP43234 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSOP43234 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSOP43234 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSOP43234 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSOP43234 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSOP43234 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms