Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt4.73□□□□□ -1.65
SEC28P40509 YBR219CYBR219C 384 nt4.73□□□□□ -1.65
SEC28P40509 MST1YKL194C 1389 nt4.73□□□□□ -1.65
SEC28P40509 PRO2YOR323C 1371 nt4.73□□□□□ -1.65
SEC28P40509 SKG3YLR187W 3081 nt4.73□□□□□ -1.65
SEC28P40509 RAD30YDR419W 1899 nt4.73□□□□□ -1.65
SEC28P40509 YAP1802YGR241C 1707 nt4.72□□□□□ -1.65
SEC28P40509 YKR047WYKR047W 306 nt4.72□□□□□ -1.65
SEC28P40509 RPS31YLR167W 459 nt4.72□□□□□ -1.65
SEC28P40509 SIR1YKR101W 1965 nt4.72□□□□□ -1.65
SEC28P40509 BBC1YJL020C 3474 nt4.71□□□□□ -1.66
SEC28P40509 YER067C-AYER067C-A 324 nt4.71□□□□□ -1.66
SEC28P40509 NAT2YGR147C 867 nt4.71□□□□□ -1.66
SEC28P40509 PSR1YLL010C 1284 nt4.71□□□□□ -1.66
SEC28P40509 ORM2YLR350W 651 nt4.71□□□□□ -1.66
SEC28P40509 YPR015CYPR015C 744 nt4.71□□□□□ -1.66
SEC28P40509 ANT1YPR128C 987 nt4.71□□□□□ -1.66
SEC28P40509 BSD2YBR290W 966 nt4.71□□□□□ -1.66
SEC28P40509 TFA1YKL028W 1449 nt4.71□□□□□ -1.66
SEC28P40509 YJL206CYJL206C 2277 nt4.7□□□□□ -1.66
SEC28P40509 CLF1YLR117C 2064 nt4.7□□□□□ -1.66
SEC28P40509 CAF16YFL028C 870 nt4.7□□□□□ -1.66
SEC28P40509 YGR079WYGR079W 1113 nt4.7□□□□□ -1.66
SEC28P40509 RFC2YJR068W 1062 nt4.7□□□□□ -1.66
SEC28P40509 PRM2YIL037C 1971 nt4.7□□□□□ -1.66
SEC28P40509 PAN1YIR006C 4443 nt4.7□□□□□ -1.66
SEC28P40509 PDR15YDR406W 4590 nt4.7□□□□□ -1.66
SEC28P40509 TCM62YBR044C 1719 nt4.69□□□□□ -1.66
SEC28P40509 AXL2YIL140W 2472 nt4.69□□□□□ -1.66
SEC28P40509 ENT1YDL161W 1365 nt4.69□□□□□ -1.66
SEC28P40509 CDC6YJL194W 1542 nt4.69□□□□□ -1.66
SEC28P40509 SUT1YGL162W 900 nt4.69□□□□□ -1.66
SEC28P40509 SAE3YHR079C-A 276 nt4.69□□□□□ -1.66
SEC28P40509 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt4.69□□□□□ -1.66
SEC28P40509 SRN2YLR119W 642 nt4.69□□□□□ -1.66
SEC28P40509 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt4.69□□□□□ -1.66
SEC28P40509 YLR402WYLR402W 192 nt4.69□□□□□ -1.66
SEC28P40509 SPS19YNL202W 879 nt4.69□□□□□ -1.66
SEC28P40509 MRP21YBL090W 534 nt4.69□□□□□ -1.66
SEC28P40509 CDC21YOR074C 915 nt4.69□□□□□ -1.66
SEC28P40509 HOT1YMR172W 2160 nt4.69□□□□□ -1.66
SEC28P40509 TDA7YNL176C 1911 nt4.69□□□□□ -1.66
SEC28P40509 GDE1YPL110C 3672 nt4.69□□□□□ -1.66
SEC28P40509 MNT2YGL257C 1677 nt4.68□□□□□ -1.66
SEC28P40509 RPL34AYER056C-A 366 nt4.68□□□□□ -1.66
SEC28P40509 ERV14YGL054C 417 nt4.68□□□□□ -1.66
SEC28P40509 PFK1YGR240C 2964 nt4.68□□□□□ -1.66
SEC28P40509 YKR075CYKR075C 924 nt4.68□□□□□ -1.66
SEC28P40509 NSE1YLR007W 1011 nt4.68□□□□□ -1.66
SEC28P40509 YML119WYML119W 1074 nt4.68□□□□□ -1.66
SEC28P40509 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt4.68□□□□□ -1.66
SEC28P40509 SOF1YLL011W 1470 nt4.68□□□□□ -1.66
SEC28P40509 GMC1YDR506C 1827 nt4.67□□□□□ -1.66
SEC28P40509 CNA1YLR433C 1662 nt4.67□□□□□ -1.66
SEC28P40509 RVB1YDR190C 1392 nt4.67□□□□□ -1.66
SEC28P40509 YCR050CYCR050C 309 nt4.67□□□□□ -1.66
SEC28P40509 MMS21YEL019C 804 nt4.67□□□□□ -1.66
SEC28P40509 NPY1YGL067W 1155 nt4.67□□□□□ -1.66
SEC28P40509 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt4.67□□□□□ -1.66
SEC28P40509 KTR2YKR061W 1278 nt4.67□□□□□ -1.66
SEC28P40509 PNP1YLR209C 936 nt4.67□□□□□ -1.66
SEC28P40509 YAR061WYAR061W 204 nt4.67□□□□□ -1.66
SEC28P40509 SUP35YDR172W 2058 nt4.67□□□□□ -1.66
SEC28P40509 TRM44YPL030W 1704 nt4.66□□□□□ -1.66
SEC28P40509 KRE6YPR159W 2163 nt4.66□□□□□ -1.66
SEC28P40509 YPL191CYPL191C 1083 nt4.66□□□□□ -1.66
SEC28P40509 AVT1YJR001W 1809 nt4.66□□□□□ -1.66
SEC28P40509 MPS3YJL019W 2049 nt4.66□□□□□ -1.66
SEC28P40509 NOP8YOL144W 1455 nt4.66□□□□□ -1.66
SEC28P40509 GSM1YJL103C 1857 nt4.66□□□□□ -1.66
SEC28P40509 APC4YDR118W 1959 nt4.65□□□□□ -1.66
SEC28P40509 CTF18YMR078C 2226 nt4.65□□□□□ -1.66
SEC28P40509 CDC9YDL164C 2268 nt4.65□□□□□ -1.66
SEC28P40509 YEL045CYEL045C 426 nt4.65□□□□□ -1.67
SEC28P40509 YLR374CYLR374C 390 nt4.65□□□□□ -1.67
SEC28P40509 YGP1YNL160W 1065 nt4.65□□□□□ -1.67
SEC28P40509 SLZ1YNL196C 897 nt4.65□□□□□ -1.67
SEC28P40509 ATG14YBR128C 1035 nt4.65□□□□□ -1.67
SEC28P40509 NFI1YOR156C 2181 nt4.65□□□□□ -1.67
SEC28P40509 MDM30YLR368W 1797 nt4.65□□□□□ -1.67
SEC28P40509 HER2YMR293C 1395 nt4.65□□□□□ -1.67
SEC28P40509 KGD1YIL125W 3045 nt4.64□□□□□ -1.67
SEC28P40509 MDR1YGR100W 2853 nt4.64□□□□□ -1.67
SEC28P40509 THI7YLR237W 1797 nt4.64□□□□□ -1.67
SEC28P40509 BUR6YER159C 429 nt4.64□□□□□ -1.67
SEC28P40509 YGR015CYGR015C 987 nt4.64□□□□□ -1.67
SEC28P40509 YHL049CYHL049C 816 nt4.64□□□□□ -1.67
SEC28P40509 YIL152WYIL152W 708 nt4.64□□□□□ -1.67
SEC28P40509 DAN1YJR150C 897 nt4.64□□□□□ -1.67
SEC28P40509 BUD17YNR027W 954 nt4.64□□□□□ -1.67
SEC28P40509 PUT2YHR037W 1728 nt4.63□□□□□ -1.67
SEC28P40509 SAP4YGL229C 2457 nt4.63□□□□□ -1.67
SEC28P40509 CPR4YCR069W 957 nt4.63□□□□□ -1.67
SEC28P40509 YDL027CYDL027C 1263 nt4.63□□□□□ -1.67
SEC28P40509 HNT2YDR305C 654 nt4.63□□□□□ -1.67
SEC28P40509 YGL193CYGL193C 312 nt4.63□□□□□ -1.67
SEC28P40509 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt4.63□□□□□ -1.67
SEC28P40509 GON7YJL184W 372 nt4.63□□□□□ -1.67
SEC28P40509 MRPL39YML009C 213 nt4.63□□□□□ -1.67
SEC28P40509 snR19snR19 568 nt4.63□□□□□ -1.67
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