Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMB4P28070 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms