Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX1P22670 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX1P22670 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX1P22670 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX1P22670 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX1P22670 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX1P22670 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX1P22670 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX1P22670 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX1P22670 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX1P22670 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX1P22670 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX1P22670 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX1P22670 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX1P22670 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX1P22670 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX1P22670 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX1P22670 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX1P22670 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX1P22670 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX1P22670 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX1P22670 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX1P22670 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX1P22670 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX1P22670 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RFX1P22670 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RFX1P22670 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RFX1P22670 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RFX1P22670 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX1P22670 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX1P22670 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX1P22670 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX1P22670 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX1P22670 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX1P22670 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX1P22670 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX1P22670 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX1P22670 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX1P22670 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFX1P22670 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFX1P22670 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFX1P22670 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFX1P22670 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFX1P22670 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RFX1P22670 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFX1P22670 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFX1P22670 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFX1P22670 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFX1P22670 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFX1P22670 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RFX1P22670 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFX1P22670 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RFX1P22670 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RFX1P22670 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFX1P22670 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFX1P22670 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFX1P22670 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFX1P22670 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFX1P22670 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFX1P22670 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFX1P22670 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFX1P22670 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFX1P22670 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFX1P22670 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFX1P22670 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFX1P22670 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFX1P22670 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFX1P22670 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFX1P22670 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFX1P22670 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFX1P22670 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RFX1P22670 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFX1P22670 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX1P22670 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX1P22670 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX1P22670 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX1P22670 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX1P22670 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX1P22670 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX1P22670 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX1P22670 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX1P22670 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX1P22670 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX1P22670 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX1P22670 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX1P22670 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX1P22670 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX1P22670 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX1P22670 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX1P22670 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX1P22670 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX1P22670 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFX1P22670 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFX1P22670 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFX1P22670 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFX1P22670 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFX1P22670 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFX1P22670 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFX1P22670 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFX1P22670 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms