Protein–RNA interactions for Protein: P17035

ZNF28, Zinc finger protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF28P17035 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF28P17035 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF28P17035 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF28P17035 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF28P17035 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF28P17035 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF28P17035 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF28P17035 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF28P17035 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF28P17035 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF28P17035 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF28P17035 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF28P17035 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF28P17035 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF28P17035 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF28P17035 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF28P17035 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF28P17035 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF28P17035 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF28P17035 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF28P17035 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF28P17035 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF28P17035 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF28P17035 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF28P17035 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF28P17035 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF28P17035 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF28P17035 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF28P17035 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF28P17035 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF28P17035 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF28P17035 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF28P17035 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF28P17035 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF28P17035 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF28P17035 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF28P17035 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF28P17035 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF28P17035 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF28P17035 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF28P17035 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF28P17035 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF28P17035 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF28P17035 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF28P17035 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF28P17035 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF28P17035 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms