Protein–RNA interactions for Protein: P02381

VAR1, Ribosomal protein VAR1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 398 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	P02381	SAE3	YHR079C-A	276 nt		3.49	□□□□□ -1.85
VAR1	P02381	ADD66	YKL206C	804 nt		3.49	□□□□□ -1.85
VAR1	P02381	YRA2	YKL214C	612 nt		3.49	□□□□□ -1.85
VAR1	P02381	TVP38	YKR088C	1014 nt		3.49	□□□□□ -1.85
VAR1	P02381	SWC7	YLR385C	399 nt		3.49	□□□□□ -1.85
VAR1	P02381	SSO1	YPL232W	873 nt		3.49	□□□□□ -1.85
VAR1	P02381	VID28	YIL017C	2766 nt		3.49	□□□□□ -1.85
VAR1	P02381	YPR003C	YPR003C	2265 nt		3.49	□□□□□ -1.85
VAR1	P02381	YER077C	YER077C	2067 nt		3.48	□□□□□ -1.85
VAR1	P02381	SAP4	YGL229C	2457 nt		3.48	□□□□□ -1.85
VAR1	P02381	YER158C	YER158C	1722 nt		3.48	□□□□□ -1.85
VAR1	P02381	YGL188C	YGL188C	174 nt		3.48	□□□□□ -1.85
VAR1	P02381	NAT2	YGR147C	867 nt		3.48	□□□□□ -1.85
VAR1	P02381	YJR012C	YJR012C	624 nt		3.48	□□□□□ -1.85
VAR1	P02381	YPL191C	YPL191C	1083 nt		3.48	□□□□□ -1.85
VAR1	P02381	SLD2	YKL108W	1362 nt		3.48	□□□□□ -1.85
VAR1	P02381	PAH1	YMR165C	2589 nt		3.48	□□□□□ -1.85
VAR1	P02381	CDC14	YFR028C	1656 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VAR1	P02381	TEL1	YBL088C	8364 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VAR1	P02381	GLN4	YOR168W	2430 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VAR1	P02381	CPR4	YCR069W	957 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VAR1	P02381	YIL021C-A	YIL021C-A	270 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VAR1	P02381	REX4	YOL080C	870 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VAR1	P02381	HSP26	YBR072W	645 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VAR1	P02381	YGR066C	YGR066C	879 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	DCD1	YHR144C	939 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	LDB18	YLL049W	540 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	ELA1	YNL230C	1140 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	MRM1	YOR201C	1239 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	STE12	YHR084W	2067 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	PRP9	YDL030W	1593 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	UBP6	YFR010W	1500 nt		3.45	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	SWI3	YJL176C	2478 nt		3.45	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	RAM1	YDL090C	1296 nt		3.45	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	SNA2	YDR525W-A	240 nt		3.45	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	COX2	Q0250	756 nt		3.45	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	YAL047W-A	YAL047W-A	330 nt		3.45	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	CBF5	YLR175W	1452 nt		3.45	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	DBP3	YGL078C	1572 nt		3.45	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	MET4	YNL103W	2019 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	RIA1	YNL163C	3333 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	RPO31	YOR116C	4383 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	MCD4	YKL165C	2760 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	MSC2	YDR205W	2175 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	NOP8	YOL144W	1455 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	ARG82	YDR173C	1068 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	SPR28	YDR218C	1272 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	MRPL39	YML009C	213 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	ADD37	YMR184W	597 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	YNL134C	YNL134C	1131 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	AIF1	YNR074C	1137 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	ARG8	YOL140W	1272 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	RDL1	YOR285W	420 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	RIM4	YHL024W	2142 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	TAF8	YML114C	1533 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	WTM1	YOR230W	1314 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	GPI10	YGL142C	1851 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	HO	YDL227C	1761 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	YDL027C	YDL027C	1263 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	PRP11	YDL043C	801 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	LPP1	YDR503C	825 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	SPO73	YER046W	432 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	RNA15	YGL044C	891 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	IRC9	YJL142C	393 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	OAR1	YKL055C	837 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	MRPL4	YLR439W	960 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	AIM10	YER087W	1731 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	NHX1	YDR456W	1902 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	PMT4	YJR143C	2289 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	SEG1	YMR086W	2883 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	JHD2	YJR119C	2187 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	ZPR1	YGR211W	1461 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	ATG2	YNL242W	4779 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	snR7-S	snR7-S	179 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	TYW3	YGL050W	822 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	COA3	YJL062W-A	258 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	YKL169C	YKL169C	384 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	SAP30	YMR263W	606 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	RAD52	YML032C	1416 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	FMP30	YPL103C	1407 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	PEP5	YMR231W	3090 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	ATM1	YMR301C	2073 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	CBP1	YJL209W	1965 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	KRE5	YOR336W	4098 nt		3.41	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	ALG6	YOR002W	1635 nt		3.41	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	KRE29	YER038C	1395 nt		3.41	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	CYM1	YDR430C	2970 nt		3.41	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	PER1	YCR044C	1074 nt		3.41	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	CYC1	YJR048W	330 nt		3.41	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	IES3	YLR052W	753 nt		3.41	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	FEX1	YOR390W	1128 nt		3.41	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	FEX2	YPL279C	1128 nt		3.41	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	ATG14	YBR128C	1035 nt		3.41	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	SRO7	YPR032W	3102 nt		3.41	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	VPS73	YGL104C	1461 nt		3.41	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	PIM1	YBL022C	3402 nt		3.4	□□□□□ -1.86
VAR1	P02381	SPI1	YER150W	447 nt		3.4	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	PEX30	YLR324W	1572 nt		3.4	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	CUS2	YNL286W	858 nt		3.4	□□□□□ -1.87
VAR1	P02381	GAL11	YOL051W	3246 nt		3.4	□□□□□ -1.87

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