Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TOP3BO95985 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP3BO95985 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms