Protein–RNA interactions for Protein: O75783

RHBDL1, Rhomboid-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL1O75783 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDL1O75783 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDL1O75783 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDL1O75783 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDL1O75783 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDL1O75783 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDL1O75783 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDL1O75783 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDL1O75783 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDL1O75783 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDL1O75783 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDL1O75783 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDL1O75783 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDL1O75783 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDL1O75783 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDL1O75783 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDL1O75783 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDL1O75783 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDL1O75783 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDL1O75783 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDL1O75783 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDL1O75783 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDL1O75783 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDL1O75783 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDL1O75783 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDL1O75783 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDL1O75783 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDL1O75783 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDL1O75783 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDL1O75783 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHBDL1O75783 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHBDL1O75783 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHBDL1O75783 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHBDL1O75783 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHBDL1O75783 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHBDL1O75783 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHBDL1O75783 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms