Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3BO75182 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIN3BO75182 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms