Protein–RNA interactions for Protein: O60869

EDF1, Endothelial differentiation-related factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDF1O60869 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDF1O60869 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDF1O60869 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDF1O60869 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDF1O60869 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDF1O60869 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDF1O60869 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDF1O60869 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDF1O60869 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDF1O60869 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDF1O60869 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDF1O60869 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EDF1O60869 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDF1O60869 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDF1O60869 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDF1O60869 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDF1O60869 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDF1O60869 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDF1O60869 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDF1O60869 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDF1O60869 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDF1O60869 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDF1O60869 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDF1O60869 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDF1O60869 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDF1O60869 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDF1O60869 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDF1O60869 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDF1O60869 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDF1O60869 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDF1O60869 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDF1O60869 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDF1O60869 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDF1O60869 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDF1O60869 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDF1O60869 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDF1O60869 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDF1O60869 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDF1O60869 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDF1O60869 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDF1O60869 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDF1O60869 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDF1O60869 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDF1O60869 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDF1O60869 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDF1O60869 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDF1O60869 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDF1O60869 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDF1O60869 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EDF1O60869 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDF1O60869 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDF1O60869 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDF1O60869 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDF1O60869 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDF1O60869 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDF1O60869 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDF1O60869 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDF1O60869 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDF1O60869 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDF1O60869 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDF1O60869 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDF1O60869 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EDF1O60869 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDF1O60869 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDF1O60869 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDF1O60869 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDF1O60869 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDF1O60869 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDF1O60869 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDF1O60869 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDF1O60869 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDF1O60869 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDF1O60869 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDF1O60869 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDF1O60869 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDF1O60869 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDF1O60869 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDF1O60869 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDF1O60869 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDF1O60869 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDF1O60869 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDF1O60869 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDF1O60869 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDF1O60869 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDF1O60869 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDF1O60869 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDF1O60869 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDF1O60869 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDF1O60869 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDF1O60869 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDF1O60869 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDF1O60869 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDF1O60869 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDF1O60869 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDF1O60869 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDF1O60869 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDF1O60869 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDF1O60869 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EDF1O60869 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDF1O60869 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms