Protein–RNA interactions for Protein: O60522

TDRD6, Tudor domain-containing protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD6O60522 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD6O60522 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD6O60522 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms