Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD6O43541 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD6O43541 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD6O43541 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms