Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASA4O43374 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASA4O43374 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASA4O43374 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASA4O43374 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASA4O43374 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RASA4O43374 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASA4O43374 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASA4O43374 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASA4O43374 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASA4O43374 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASA4O43374 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASA4O43374 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASA4O43374 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASA4O43374 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASA4O43374 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASA4O43374 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASA4O43374 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RASA4O43374 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASA4O43374 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASA4O43374 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASA4O43374 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASA4O43374 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASA4O43374 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASA4O43374 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASA4O43374 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASA4O43374 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASA4O43374 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASA4O43374 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASA4O43374 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASA4O43374 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASA4O43374 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASA4O43374 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASA4O43374 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASA4O43374 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASA4O43374 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASA4O43374 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASA4O43374 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASA4O43374 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RASA4O43374 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASA4O43374 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RASA4O43374 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASA4O43374 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASA4O43374 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASA4O43374 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASA4O43374 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASA4O43374 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASA4O43374 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASA4O43374 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASA4O43374 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASA4O43374 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASA4O43374 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASA4O43374 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASA4O43374 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA4O43374 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA4O43374 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA4O43374 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA4O43374 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA4O43374 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA4O43374 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA4O43374 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA4O43374 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA4O43374 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA4O43374 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA4O43374 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA4O43374 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA4O43374 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASA4O43374 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASA4O43374 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASA4O43374 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASA4O43374 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASA4O43374 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASA4O43374 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASA4O43374 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASA4O43374 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASA4O43374 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASA4O43374 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASA4O43374 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASA4O43374 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASA4O43374 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASA4O43374 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASA4O43374 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASA4O43374 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASA4O43374 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASA4O43374 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASA4O43374 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASA4O43374 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASA4O43374 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASA4O43374 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASA4O43374 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RASA4O43374 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RASA4O43374 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RASA4O43374 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RASA4O43374 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASA4O43374 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RASA4O43374 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RASA4O43374 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RASA4O43374 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RASA4O43374 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RASA4O43374 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.8 ms