Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRTM2O43300 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRRTM2O43300 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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