Protein–RNA interactions for Protein: O15146

MUSK, Muscle, skeletal receptor tyrosine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUSKO15146 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MUSKO15146 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MUSKO15146 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MUSKO15146 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MUSKO15146 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MUSKO15146 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MUSKO15146 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MUSKO15146 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MUSKO15146 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MUSKO15146 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MUSKO15146 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MUSKO15146 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MUSKO15146 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MUSKO15146 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MUSKO15146 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MUSKO15146 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MUSKO15146 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MUSKO15146 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MUSKO15146 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MUSKO15146 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MUSKO15146 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MUSKO15146 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MUSKO15146 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUSKO15146 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUSKO15146 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUSKO15146 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUSKO15146 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUSKO15146 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUSKO15146 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUSKO15146 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUSKO15146 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUSKO15146 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MUSKO15146 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUSKO15146 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUSKO15146 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUSKO15146 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MUSKO15146 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MUSKO15146 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MUSKO15146 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MUSKO15146 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MUSKO15146 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MUSKO15146 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MUSKO15146 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MUSKO15146 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MUSKO15146 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MUSKO15146 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MUSKO15146 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MUSKO15146 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MUSKO15146 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MUSKO15146 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MUSKO15146 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MUSKO15146 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MUSKO15146 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MUSKO15146 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MUSKO15146 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MUSKO15146 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MUSKO15146 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MUSKO15146 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MUSKO15146 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MUSKO15146 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MUSKO15146 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MUSKO15146 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MUSKO15146 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MUSKO15146 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MUSKO15146 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MUSKO15146 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MUSKO15146 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MUSKO15146 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MUSKO15146 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MUSKO15146 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MUSKO15146 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MUSKO15146 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MUSKO15146 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MUSKO15146 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MUSKO15146 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MUSKO15146 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MUSKO15146 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MUSKO15146 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MUSKO15146 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MUSKO15146 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MUSKO15146 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MUSKO15146 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MUSKO15146 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MUSKO15146 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MUSKO15146 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MUSKO15146 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MUSKO15146 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MUSKO15146 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MUSKO15146 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MUSKO15146 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MUSKO15146 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MUSKO15146 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MUSKO15146 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MUSKO15146 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MUSKO15146 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MUSKO15146 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MUSKO15146 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MUSKO15146 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MUSKO15146 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MUSKO15146 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms