Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
N4BP3O15049 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms