Protein–RNA interactions for Protein: H3BNG1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNG1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3BNG1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3BNG1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3BNG1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3BNG1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3BNG1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H3BNG1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3BNG1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3BNG1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BNG1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BNG1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BNG1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BNG1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BNG1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BNG1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BNG1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BNG1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BNG1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BNG1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BNG1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BNG1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BNG1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BNG1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BNG1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BNG1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BNG1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BNG1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BNG1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BNG1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BNG1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BNG1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BNG1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BNG1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BNG1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H3BNG1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3BNG1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3BNG1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3BNG1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3BNG1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3BNG1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3BNG1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3BNG1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3BNG1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3BNG1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3BNG1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BNG1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BNG1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BNG1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BNG1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BNG1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BNG1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BNG1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BNG1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BNG1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BNG1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BNG1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BNG1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BNG1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BNG1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BNG1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BNG1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BNG1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BNG1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BNG1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BNG1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BNG1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BNG1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BNG1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BNG1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BNG1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BNG1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BNG1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BNG1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BNG1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BNG1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BNG1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BNG1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BNG1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BNG1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BNG1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BNG1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BNG1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BNG1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BNG1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BNG1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BNG1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BNG1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3BNG1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3BNG1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3BNG1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3BNG1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3BNG1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3BNG1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3BNG1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3BNG1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3BNG1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3BNG1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3BNG1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3BNG1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H3BNG1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms