Protein–RNA interactions for Protein: A6NIV6

LRRIQ4, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ4A6NIV6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ4A6NIV6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ4A6NIV6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ4A6NIV6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ4A6NIV6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ4A6NIV6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ4A6NIV6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ4A6NIV6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ4A6NIV6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRIQ4A6NIV6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ4A6NIV6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ4A6NIV6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ4A6NIV6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ4A6NIV6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ4A6NIV6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ4A6NIV6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ4A6NIV6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ4A6NIV6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ4A6NIV6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ4A6NIV6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ4A6NIV6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ4A6NIV6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ4A6NIV6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ4A6NIV6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ4A6NIV6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ4A6NIV6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ4A6NIV6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ4A6NIV6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ4A6NIV6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ4A6NIV6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ4A6NIV6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRIQ4A6NIV6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRIQ4A6NIV6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRIQ4A6NIV6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRIQ4A6NIV6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRIQ4A6NIV6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms