Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LYVE1Q9Y5Y7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms