Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C4Q9UKN8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C4Q9UKN8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms