Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms