Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms