Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0B6

CCDC167, Coiled-coil domain-containing protein 167, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC167Q9P0B6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC167Q9P0B6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.6 ms