Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms