Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TREX1Q9NSU2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TREX1Q9NSU2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms