Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX15Q9NRS6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX15Q9NRS6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms