Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAPOLBQ9NRJ5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAPOLBQ9NRJ5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms