Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPRD1BQ9NQG5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPRD1BQ9NQG5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms