Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLCO1B3Q9NPD5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms