Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
DCLK3Q9C098 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DCLK3Q9C098 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DCLK3Q9C098 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
DCLK3Q9C098 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DCLK3Q9C098 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCLK3Q9C098 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DCLK3Q9C098 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
DCLK3Q9C098 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCLK3Q9C098 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCLK3Q9C098 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCLK3Q9C098 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCLK3Q9C098 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCLK3Q9C098 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCLK3Q9C098 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCLK3Q9C098 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCLK3Q9C098 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCLK3Q9C098 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCLK3Q9C098 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCLK3Q9C098 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCLK3Q9C098 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCLK3Q9C098 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCLK3Q9C098 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCLK3Q9C098 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCLK3Q9C098 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCLK3Q9C098 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCLK3Q9C098 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCLK3Q9C098 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCLK3Q9C098 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCLK3Q9C098 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCLK3Q9C098 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCLK3Q9C098 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCLK3Q9C098 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCLK3Q9C098 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCLK3Q9C098 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCLK3Q9C098 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCLK3Q9C098 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCLK3Q9C098 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms