Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
UPF3BQ9BZI7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UPF3BQ9BZI7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UPF3BQ9BZI7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 422 ms