Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBS2Q9BXC9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBS2Q9BXC9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.8 ms