Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC106Q9BWC9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC106Q9BWC9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms