Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUDCD1Q96RS6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUDCD1Q96RS6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms