Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ATRIPQ8WXE1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATRIPQ8WXE1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms