Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTL3Q8N8U3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTL3Q8N8U3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTL3Q8N8U3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTL3Q8N8U3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTL3Q8N8U3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTL3Q8N8U3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTL3Q8N8U3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTL3Q8N8U3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RTL3Q8N8U3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL3Q8N8U3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms