Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2H9

PELI3, E3 ubiquitin-protein ligase pellino homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PELI3Q8N2H9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PELI3Q8N2H9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.7 ms