Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NFXL1Q6ZNB6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms