Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S1

DENND1B, DENN domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND1BQ6P3S1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DENND1BQ6P3S1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DENND1BQ6P3S1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DENND1BQ6P3S1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms