Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RSBN1Q5VWQ0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RSBN1Q5VWQ0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms