Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01545Q5VT33 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms