Protein–RNA interactions for Protein: Q32P44

EML3, Echinoderm microtubule-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EML3Q32P44 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EML3Q32P44 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EML3Q32P44 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EML3Q32P44 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EML3Q32P44 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EML3Q32P44 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EML3Q32P44 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EML3Q32P44 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EML3Q32P44 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EML3Q32P44 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EML3Q32P44 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EML3Q32P44 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EML3Q32P44 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EML3Q32P44 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EML3Q32P44 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EML3Q32P44 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EML3Q32P44 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EML3Q32P44 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EML3Q32P44 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EML3Q32P44 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EML3Q32P44 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EML3Q32P44 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EML3Q32P44 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EML3Q32P44 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EML3Q32P44 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EML3Q32P44 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EML3Q32P44 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EML3Q32P44 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EML3Q32P44 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EML3Q32P44 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EML3Q32P44 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EML3Q32P44 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EML3Q32P44 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EML3Q32P44 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EML3Q32P44 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EML3Q32P44 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EML3Q32P44 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms