Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCK2Q16822 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCK2Q16822 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PCK2Q16822 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCK2Q16822 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCK2Q16822 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCK2Q16822 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCK2Q16822 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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PCK2Q16822 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCK2Q16822 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PCK2Q16822 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PCK2Q16822 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PCK2Q16822 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PCK2Q16822 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PCK2Q16822 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PCK2Q16822 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PCK2Q16822 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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