Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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EXT1Q16394 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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EXT1Q16394 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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EXT1Q16394 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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EXT1Q16394 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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EXT1Q16394 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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EXT1Q16394 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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EXT1Q16394 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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EXT1Q16394 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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EXT1Q16394 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
EXT1Q16394 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
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EXT1Q16394 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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EXT1Q16394 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
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