Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SS18Q15532 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SS18Q15532 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SS18Q15532 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SS18Q15532 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SS18Q15532 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SS18Q15532 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SS18Q15532 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SS18Q15532 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SS18Q15532 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SS18Q15532 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SS18Q15532 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SS18Q15532 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SS18Q15532 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SS18Q15532 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SS18Q15532 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SS18Q15532 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SS18Q15532 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SS18Q15532 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SS18Q15532 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SS18Q15532 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SS18Q15532 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SS18Q15532 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SS18Q15532 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SS18Q15532 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SS18Q15532 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SS18Q15532 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SS18Q15532 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SS18Q15532 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SS18Q15532 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SS18Q15532 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SS18Q15532 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SS18Q15532 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SS18Q15532 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SS18Q15532 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SS18Q15532 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SS18Q15532 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SS18Q15532 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SS18Q15532 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SS18Q15532 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SS18Q15532 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SS18Q15532 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SS18Q15532 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SS18Q15532 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SS18Q15532 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SS18Q15532 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SS18Q15532 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SS18Q15532 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SS18Q15532 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SS18Q15532 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SS18Q15532 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SS18Q15532 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SS18Q15532 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SS18Q15532 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SS18Q15532 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SS18Q15532 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SS18Q15532 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SS18Q15532 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SS18Q15532 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SS18Q15532 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SS18Q15532 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SS18Q15532 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SS18Q15532 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SS18Q15532 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SS18Q15532 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SS18Q15532 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SS18Q15532 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SS18Q15532 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SS18Q15532 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SS18Q15532 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SS18Q15532 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SS18Q15532 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SS18Q15532 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SS18Q15532 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SS18Q15532 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SS18Q15532 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SS18Q15532 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SS18Q15532 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SS18Q15532 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SS18Q15532 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SS18Q15532 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SS18Q15532 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SS18Q15532 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SS18Q15532 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SS18Q15532 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SS18Q15532 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SS18Q15532 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SS18Q15532 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SS18Q15532 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SS18Q15532 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SS18Q15532 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SS18Q15532 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SS18Q15532 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SS18Q15532 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SS18Q15532 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SS18Q15532 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SS18Q15532 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SS18Q15532 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SS18Q15532 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SS18Q15532 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms