Protein–RNA interactions for Protein: Q12491

TY2B-B, Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-BQ12491 ODC2YOR222W 924 nt6.2□□□□□ -1.42
TY2B-BQ12491 GPI13YLL031C 3054 nt6.2□□□□□ -1.42
TY2B-BQ12491 DAL4YIR028W 1908 nt6.19□□□□□ -1.42
TY2B-BQ12491 snR7-SsnR7-S 179 nt6.19□□□□□ -1.42
TY2B-BQ12491 YDR391CYDR391C 699 nt6.19□□□□□ -1.42
TY2B-BQ12491 YIL077CYIL077C 963 nt6.19□□□□□ -1.42
TY2B-BQ12491 HSP150YJL159W 1242 nt6.19□□□□□ -1.42
TY2B-BQ12491 snR17bsnR17b 332 nt6.19□□□□□ -1.42
TY2B-BQ12491 ARX1YDR101C 1782 nt6.19□□□□□ -1.42
TY2B-BQ12491 GIP2YER054C 1647 nt6.19□□□□□ -1.42
TY2B-BQ12491 RPA14YDR156W 414 nt6.18□□□□□ -1.42
TY2B-BQ12491 YGL185CYGL185C 1140 nt6.18□□□□□ -1.42
TY2B-BQ12491 MPS3YJL019W 2049 nt6.17□□□□□ -1.42
TY2B-BQ12491 KRE6YPR159W 2163 nt6.17□□□□□ -1.42
TY2B-BQ12491 SEA4YBL104C 3117 nt6.17□□□□□ -1.42
TY2B-BQ12491 YDR230WYDR230W 348 nt6.17□□□□□ -1.42
TY2B-BQ12491 PXA1YPL147W 2613 nt6.17□□□□□ -1.42
TY2B-BQ12491 BRE4YDL231C 3378 nt6.17□□□□□ -1.42
TY2B-BQ12491 TVP38YKR088C 1014 nt6.16□□□□□ -1.42
TY2B-BQ12491 RPS19AYOL121C 435 nt6.16□□□□□ -1.42
TY2B-BQ12491 YOR296WYOR296W 3870 nt6.16□□□□□ -1.42
TY2B-BQ12491 FOB1YDR110W 1701 nt6.16□□□□□ -1.42
TY2B-BQ12491 EUG1YDR518W 1554 nt6.15□□□□□ -1.42
TY2B-BQ12491 RPL24AYGL031C 468 nt6.14□□□□□ -1.43
TY2B-BQ12491 FDC1YDR539W 1512 nt6.14□□□□□ -1.43
TY2B-BQ12491 YIR007WYIR007W 2295 nt6.14□□□□□ -1.43
TY2B-BQ12491 IMA1YGR287C 1770 nt6.13□□□□□ -1.43
TY2B-BQ12491 KTR2YKR061W 1278 nt6.13□□□□□ -1.43
TY2B-BQ12491 SUI1YNL244C 327 nt6.13□□□□□ -1.43
TY2B-BQ12491 SUA7YPR086W 1038 nt6.13□□□□□ -1.43
TY2B-BQ12491 TKL1YPR074C 2043 nt6.13□□□□□ -1.43
TY2B-BQ12491 JEN1YKL217W 1851 nt6.13□□□□□ -1.43
TY2B-BQ12491 AXL2YIL140W 2472 nt6.12□□□□□ -1.43
TY2B-BQ12491 UBA1YKL210W 3075 nt6.12□□□□□ -1.43
TY2B-BQ12491 VPS30YPL120W 1674 nt6.11□□□□□ -1.43
TY2B-BQ12491 LHP1YDL051W 828 nt6.11□□□□□ -1.43
TY2B-BQ12491 PCS60YBR222C 1632 nt6.11□□□□□ -1.43
TY2B-BQ12491 THI13YDL244W 1023 nt6.11□□□□□ -1.43
TY2B-BQ12491 THI11YJR156C 1023 nt6.11□□□□□ -1.43
TY2B-BQ12491 RPL22AYLR061W 366 nt6.11□□□□□ -1.43
TY2B-BQ12491 SSM4YIL030C 3960 nt6.1□□□□□ -1.43
TY2B-BQ12491 KIN3YAR018C 1308 nt6.1□□□□□ -1.43
TY2B-BQ12491 NMT1YLR195C 1368 nt6.1□□□□□ -1.43
TY2B-BQ12491 AAD3YCR107W 1092 nt6.09□□□□□ -1.43
TY2B-BQ12491 ASC1YMR116C 960 nt6.09□□□□□ -1.43
TY2B-BQ12491 RDL1YOR285W 420 nt6.09□□□□□ -1.43
TY2B-BQ12491 HIS5YIL116W 1158 nt6.08□□□□□ -1.44
TY2B-BQ12491 YPR174CYPR174C 666 nt6.08□□□□□ -1.44
TY2B-BQ12491 MET4YNL103W 2019 nt6.08□□□□□ -1.44
TY2B-BQ12491 BSC1YDL037C 987 nt6.08□□□□□ -1.44
TY2B-BQ12491 HLJ1YMR161W 675 nt6.08□□□□□ -1.44
TY2B-BQ12491 BMT2YBR141C 1014 nt6.08□□□□□ -1.44
TY2B-BQ12491 LRG1YDL240W 3054 nt6.08□□□□□ -1.44
TY2B-BQ12491 BOP2YLR267W 1713 nt6.07□□□□□ -1.44
TY2B-BQ12491 YBR225WYBR225W 2703 nt6.07□□□□□ -1.44
TY2B-BQ12491 GTT1YIR038C 705 nt6.06□□□□□ -1.44
TY2B-BQ12491 BBC1YJL020C 3474 nt6.06□□□□□ -1.44
TY2B-BQ12491 PFK1YGR240C 2964 nt6.06□□□□□ -1.44
TY2B-BQ12491 RAD14YMR201C 1116 nt6.06□□□□□ -1.44
TY2B-BQ12491 HEM15YOR176W 1182 nt6.06□□□□□ -1.44
TY2B-BQ12491 SSU1YPL092W 1377 nt6.05□□□□□ -1.44
TY2B-BQ12491 ALT2YDR111C 1524 nt6.04□□□□□ -1.44
TY2B-BQ12491 YKR104WYKR104W 921 nt6.03□□□□□ -1.44
TY2B-BQ12491 YAR030CYAR030C 342 nt6.03□□□□□ -1.44
TY2B-BQ12491 HXT17YNR072W 1695 nt6.03□□□□□ -1.44
TY2B-BQ12491 YEN1YER041W 2280 nt6.03□□□□□ -1.44
TY2B-BQ12491 YER077CYER077C 2067 nt6.02□□□□□ -1.44
TY2B-BQ12491 CLA4YNL298W 2529 nt6.02□□□□□ -1.44
TY2B-BQ12491 MMT1YMR177W 1533 nt6.02□□□□□ -1.45
TY2B-BQ12491 CDC4YFL009W 2340 nt6.02□□□□□ -1.45
TY2B-BQ12491 DUG1YFR044C 1446 nt6.02□□□□□ -1.45
TY2B-BQ12491 GLO4YOR040W 858 nt6.02□□□□□ -1.45
TY2B-BQ12491 VPS53YJL029C 2469 nt6.02□□□□□ -1.45
TY2B-BQ12491 RPO31YOR116C 4383 nt6.02□□□□□ -1.45
TY2B-BQ12491 ROD1YOR018W 2514 nt6.01□□□□□ -1.45
TY2B-BQ12491 PCL10YGL134W 1302 nt6.01□□□□□ -1.45
TY2B-BQ12491 ELO2YCR034W 1044 nt6.01□□□□□ -1.45
TY2B-BQ12491 YPR022CYPR022C 3402 nt6.01□□□□□ -1.45
TY2B-BQ12491 PUB1YNL016W 1362 nt6□□□□□ -1.45
TY2B-BQ12491 MAG1YER142C 891 nt6□□□□□ -1.45
TY2B-BQ12491 HSP104YLL026W 2727 nt6□□□□□ -1.45
TY2B-BQ12491 MRH4YGL064C 1686 nt5.99□□□□□ -1.45
TY2B-BQ12491 NUP2YLR335W 2163 nt5.99□□□□□ -1.45
TY2B-BQ12491 MTC3YGL226W 372 nt5.99□□□□□ -1.45
TY2B-BQ12491 YGR017WYGR017W 894 nt5.99□□□□□ -1.45
TY2B-BQ12491 YLR296WYLR296W 327 nt5.99□□□□□ -1.45
TY2B-BQ12491 RIP1YEL024W 648 nt5.98□□□□□ -1.45
TY2B-BQ12491 DAL81YIR023W 2913 nt5.98□□□□□ -1.45
TY2B-BQ12491 YSF3YNL138W-A 258 nt5.98□□□□□ -1.45
TY2B-BQ12491 PPG1YNR032W 1107 nt5.98□□□□□ -1.45
TY2B-BQ12491 FHL1YPR104C 2811 nt5.98□□□□□ -1.45
TY2B-BQ12491 ARG4YHR018C 1392 nt5.98□□□□□ -1.45
TY2B-BQ12491 YMR084WYMR084W 789 nt5.98□□□□□ -1.45
TY2B-BQ12491 BIK1YCL029C 1323 nt5.97□□□□□ -1.45
TY2B-BQ12491 YMR130WYMR130W 909 nt5.97□□□□□ -1.45
TY2B-BQ12491 CLF1YLR117C 2064 nt5.97□□□□□ -1.45
TY2B-BQ12491 MET3YJR010W 1536 nt5.96□□□□□ -1.45
TY2B-BQ12491 FOL2YGR267C 732 nt5.96□□□□□ -1.46
TY2B-BQ12491 AAP1YHR047C 2571 nt5.96□□□□□ -1.46
TY2B-BQ12491 ERG7YHR072W 2196 nt5.96□□□□□ -1.46
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