Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC63Q05C16 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC63Q05C16 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms